Die Santé publique France als Inhaberin der Marke Nutri-Score hat die Benutzungsbedingungen für die Verwendung des Nutri-Score veröffentlicht. Diese definieren neben der Berechnungsanweisung, wer berechtigt ist, das Nutri-Score-Logo zu verwenden, welche Voraussetzungen für die Verwendung des Logos erfüllt sein müssen, welche Grafikcharta einzuhalten ist und welche Sanktionen verhängt werden, wenn die Benutzungsbedingungen nicht beachtet werden.

Unternehmen, die den Nutri-Score verwenden wollen, müssen sich vor einer Nutzung des Nutri-Score bei der Santé publique France registrieren.